Olá,

Depende da empresa. Existem softwares voltados ao setor de Recursos Humanos (ou Departamento Pessoal) que fazem todos os cálculos automaticamente, onde a única necessidade é efetuar lançamentos de atestados, horas trabalhadas, algum desconto eventual, etc.

Quando a empresa possui poucos funcionários os cálculos podem ser feitos manualmente (ou com o auxílio do Excel, que não deixa de ser manual).

Boa noite.

isto depende de cada empresa e do contador.