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溫寶裕、胡說及良晨美景在博物館內發現一具木乃伊，在層層布條包裹下的居然是一個『活的』怪蛹。衛斯理調查下去，竟然和太平天國的秘密有關......

原來有人為幾個人最初形成的胚胎，進行了遺傳密碼的變更手術。那是極其複雜的生物化學變化過程，涉及到生命最初形式，和蛋白質的改變，雙螺旋節段螺旋的改變，雙鍊核甘酸新合成的ＤＮＡ、氨基酸密碼三聯體的變換…...在那樣的改變之後，人的胚胎完全逸出了人原來的遺傳因子密碼的作用，由一條全然不同的方式發育成長。循新方式發育的人，樣子和傳統的人有點不同，可是智力比普通人高出許多倍，但在先天性格上，有很大的缺點。

但在續集《解開密碼》一書中，卻又推翻以上假設，可見作者想象力豐富。

密碼是關於一個怪蛹的故事。到最後，也不確定怪蛹中是什麼東西，就完結了。